臺“交通部”2016年12月1日正式收回復興航空航權，臺“民航局”表示，航權分配作業預計會在本月底完成，預計下周就會召開說明會，讓有意愿經營的業者提出申請。

臺“民航局”企劃組組長陳昭諭說，興航收回的航權數量蠻多，因此會先開說明會，向業者說明以后，請業者提出營運需求，若需求沒有超過容量班次限制，就會照業者需求分配，如果超過的話會召開航權分配會議進行分配，把整個分配建議報給臺“交通部”，等臺“交通部”核可后，就會通知業者，預估整個作業會在12月底完成。航權分配完成后，就會進行航權抽辦包括申請時間帶、航線證書、報班表票價，得跟雙方民航主管機關分別進行作業。

目前復興航空兩岸航線共26條航線、每周共61班，其中最搶手的黃金航線包括松山─上海浦東每周有3班，10月搭載率約7成4，臺中─上海浦東航線也是每周3班，搭載率約7成，松山─虹橋航線10月搭載率也有7成9;此外，松山─福州及松山─杭州也經營得不錯，上個月載客率分別為68%及82%.